separate parsing of ssj and kres (mem management)
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00d9192993
commit
bcc64c767c
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@ -9,11 +9,13 @@ import sys
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from multiprocessing import Pool
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from multiprocessing import Pool
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import time
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import time
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CORPORA = ["kres", "ssj"]
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# logging.basicConfig(filename=Path("/var/tmp/corpusparser.log"), filemode='a', level=logging.INFO)
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# logging.basicConfig(filename=Path("/var/tmp/corpusparser.log"), filemode='a', level=logging.INFO)
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logger = logging.getLogger(__name__)
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logger = logging.getLogger(__name__)
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# lfh = logging.FileHandler("/var/tmp/fill-database.log")
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lfh = logging.FileHandler("/project/logs/fill-database.log")
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lfh = logging.StreamHandler(sys.stdout)
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# lfh = logging.StreamHandler(sys.stdout)
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formatter = logging.Formatter("%(asctime)s %(levelname)s %(message)s")
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formatter = logging.Formatter("%(asctime)s %(levelname)s %(message)s")
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lfh.setFormatter(formatter)
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lfh.setFormatter(formatter)
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logger.addHandler(lfh)
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logger.addHandler(lfh)
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@ -100,8 +102,37 @@ def _get_dbclient(args):
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return dbclient
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return dbclient
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# wrap it in a function for better garbage collection
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if __name__ == "__main__":
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def parse_ssj(args):
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parser = argparse.ArgumentParser(description="Parsing corpora kres and ssj500k.")
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parser.add_argument('--corpus', required=True)
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parser.add_argument('--kres-folder', required=False)
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parser.add_argument('--kres-srl-folder', required=False)
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parser.add_argument('--ssj-file', required=False)
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parser.add_argument('--output', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--outdir', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--dbaddr', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--dbuser', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--dbpass', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--cores', required=False, default=1)
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args = parser.parse_args()
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corpus = args.corpus
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assert (corpus in CORPORA), "Wrong corpus name."
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outdir = None
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if args.output == "file":
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outdir = Path(args.outdir)
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outdir.mkdir(parents=True, exist_ok=True)
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elif args.output == "db":
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dbclient = _get_dbclient(args)
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dbclient.valdb[corpus].ensure_index([("sid", pymongo.ASCENDING)])
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dbclient.valdb[corpus].ensure_index([("headwords", pymongo.ASCENDING)])
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dbclient.valdb[corpus].ensure_index([("functors", pymongo.ASCENDING)])
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if corpus == "ssj":
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logger.info("Parsing Ssj: {}".format(args.ssj_file))
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logger.info("Parsing Ssj: {}".format(args.ssj_file))
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ssj_parser = Parser(logger=logger, corpus="ssj")
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ssj_parser = Parser(logger=logger, corpus="ssj")
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ssj_data = ssj_parser.parse_xml_file(Path(args.ssj_file))
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ssj_data = ssj_parser.parse_xml_file(Path(args.ssj_file))
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@ -116,42 +147,9 @@ def parse_ssj(args):
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for sentence in ssj_data:
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for sentence in ssj_data:
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sentence = _db_preprocess(sentence)
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sentence = _db_preprocess(sentence)
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ssj_col.update({"sid": sentence["sid"]}, sentence, upsert=True)
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ssj_col.update({"sid": sentence["sid"]}, sentence, upsert=True)
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del ssj_parser
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del ssj_data
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if __name__ == "__main__":
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if corpus == "kres":
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parser = argparse.ArgumentParser(description="Parsing corpora kres and ssj500k.")
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parser.add_argument('--kres-folder', required=True)
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parser.add_argument('--kres-srl-folder', required=True)
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parser.add_argument('--ssj-file', required=True)
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parser.add_argument('--output', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--outdir', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--dbaddr', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--dbuser', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--dbpass', required=False, default=None)
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parser.add_argument('--cores', required=False, default=1)
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args = parser.parse_args()
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outdir = None
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if args.output == "file":
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outdir = Path(args.outdir)
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outdir.mkdir(parents=True, exist_ok=True)
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elif args.output == "db":
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# Force unique sid
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dbclient = _get_dbclient(args)
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for corpus in ["kres", "ssj"]:
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dbclient.valdb[corpus].ensure_index([("sid", pymongo.ASCENDING)])
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dbclient.valdb[corpus].ensure_index([("headwords", pymongo.ASCENDING)])
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dbclient.valdb[corpus].ensure_index([("functors", pymongo.ASCENDING)])
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# SSJ
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p = Pool(1)
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p.map(parse_ssj, [args])
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time.sleep(30)
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# Kres
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# Kres
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logger.info("Parsing Kres: {}".format(args.kres_folder))
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logger.info("Parsing Kres: {}".format(args.kres_folder))
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kres_parser = Parser(
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kres_parser = Parser(
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@ -168,4 +166,5 @@ if __name__ == "__main__":
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p = Pool(int(args.cores))
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p = Pool(int(args.cores))
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p.map(_handle_kres_file_tpl, kres_files)
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p.map(_handle_kres_file_tpl, kres_files)
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logger.info("Finished parsing.")
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logger.info("Finished parsing.")
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